新疆农业科学 ›› 2023, Vol. 60 ›› Issue (8): 1922-1930.DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2023.08.013
收稿日期:
2022-12-01
出版日期:
2023-08-20
发布日期:
2023-08-14
通信作者:
吴斌(1973-),男,新疆塔城人,研究员,博士(后),硕士生/博士生导师,研究方向为农产品贮藏与加工,(E-mail)42042615@qq.com作者简介:
王曼(1995-),女,新疆温泉人,硕士研究生,研究方向为农产品贮藏与加工,(E-mail)1803348774@qq.com
基金资助:
WANG Man1(), ZHANG Zheng2, Yilidana Dilixiati1, WU Bin2()
Received:
2022-12-01
Online:
2023-08-20
Published:
2023-08-14
Correspondence author:
WU Bin(1973-), male, native place: Tacheng, Xinjiang.Professor, research field: Storage and processing of agricultural products, (E-mail)42042615@qq.com.Supported by:
摘要:
【目的】克隆木纳格葡萄果实中谷胱甘肽-S-转移酶(glutathione-S-transferase,GST)基因VvGST1全长并研究其序列特征,为该基因在葡萄果实抗病作用和功能的研究奠定基础。【方法】根据已有的基因序列,设计3'和5'端RACE引物,利用RT-PCR和RACE技术克隆VvGST1基因cDNA全长。【结果】该基因序列全长719 bp,均为开放阅读框(ORF),共编码221个氨基酸。该基因编码蛋白相对分子质量为25.55 kDa;理论等电点pI值为6.32;分子式为C1178H1799N293O321S11;不稳定指数为39.22;该蛋白质是稳定的亲水性蛋白,不含跨膜结构域,没有预测到信号肽,可能存在于细胞基质中,是典型的基质蛋白。VvGST1氨基酸序列与棉花、桃、西梅、樱桃、李子、板栗等植物聚为一类,其中与棉花属亲缘关系最近。【结论】获得了木纳格葡萄谷胱甘肽-S-转移酶VvGST1基因全长编码序列,探明了该序列的结构特征。
中图分类号:
王曼, 张政, 伊丽达娜·迪力夏提, 吴斌. 木纳格葡萄谷胱甘肽-S-转移酶VvGST1基因克隆与序列分析[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(8): 1922-1930.
WANG Man, ZHANG Zheng, Yilidana Dilixiati, WU Bin. Cloning and bioinformatics analysis of VvGST1 from Munage tab.grapes[J]. Xinjiang Agricultural Sciences, 2023, 60(8): 1922-1930.
亚细胞定位 Subcellular location | 分值Score | ||||
---|---|---|---|---|---|
LocDB | PotLocDB | Neural Nets | Pentamers | Integral | |
细胞核 Nuclear | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.00 | 0.05 |
质膜 Plasma membrane | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.00 | 0.08 |
胞外 Extracellular | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.00 | 0.00 |
细胞质 Cytoplasmic | 10.0 | 3.0 | 0.00 | 2.44 | 8.64 |
线粒体 Mitochondrial | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 2.42 | 0.08 |
内质网 Endoplasm. retic | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.80 | 0.14 |
过氧化物酶体 Peroxisomal | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.0 | 0.00 |
高尔基体 Golgi | 0.0 | 0.0 | 0.13 | 0.26 | 0.00 |
叶绿体 Chloroplast | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.03 | 0.67 |
液泡 Vacuolar | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.00 | 0.34 |
表1 VvGST1亚细胞定位预测
Tab.1 Prediction of VvGST1 subcellular location
亚细胞定位 Subcellular location | 分值Score | ||||
---|---|---|---|---|---|
LocDB | PotLocDB | Neural Nets | Pentamers | Integral | |
细胞核 Nuclear | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.00 | 0.05 |
质膜 Plasma membrane | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.00 | 0.08 |
胞外 Extracellular | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.00 | 0.00 |
细胞质 Cytoplasmic | 10.0 | 3.0 | 0.00 | 2.44 | 8.64 |
线粒体 Mitochondrial | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 2.42 | 0.08 |
内质网 Endoplasm. retic | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.80 | 0.14 |
过氧化物酶体 Peroxisomal | 0.0 | 0.0 | 0.96 | 0.0 | 0.00 |
高尔基体 Golgi | 0.0 | 0.0 | 0.13 | 0.26 | 0.00 |
叶绿体 Chloroplast | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.03 | 0.67 |
液泡 Vacuolar | 0.0 | 0.0 | 0.00 | 0.00 | 0.34 |
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