新疆农业科学 ›› 2022, Vol. 59 ›› Issue (11): 2749-2757.DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2022.11.019
收稿日期:
2022-01-11
出版日期:
2022-11-20
发布日期:
2022-12-28
通信作者:
决肯·阿尼瓦什
作者简介:
洪文娟(1995-),女,河南人,硕士研究生,研究方向为动物遗传育种与繁殖,(E-mail)2775698805@qq.com
基金资助:
HONG Wenjuan(), HOU Chenxi, HE Zonglong, Jueken Aniwashi()
Received:
2022-01-11
Online:
2022-11-20
Published:
2022-12-28
Correspondence author:
Jueken Aniwashi
Supported by:
摘要:
【目的】研究LEF1、YWHAZ及WNT2基因表达量与毛色之间的关系,为分析LEF1、YWHAZ及WNT2基因在Wnt/β-actenin信号通路中的分子机制奠定基础。【方法】采用随机选取黑色和白色被毛的巴什拜羊各8只,采集皮肤组织,通过定量反转录聚合酶连锁反应(qRT-PCR)方法测定LEF1、WNT2及YWHAZ基因在不同毛色巴什拜羊皮肤中的表达量,并与LEF1、YWHAZ及WNT2基因转录组测序结果的FPKM值进行双向验证。【结果】LEF1基因在黑色巴什拜羊皮肤组织相对表达量是(4.66±0.59),在白色巴什拜羊皮肤组织是 (0.43±0.15);WNT2基因在黑色巴什拜羊组织相对表达量是(7.35±0.77),在白色巴什拜羊皮肤组织是(0.36±0.11);YWHAZ基因在黑色巴什拜羊组织相对表达量是 (4.44±0.57),在白色巴什拜羊皮肤组织是(1.02±0.23)。LEF1、YWHAZ及WNT2基因的转录组数据的FPKM值与qRT-PCR结果趋势一致。【结论】LEF1、WNT2及YWHAZ基因在不同毛色的巴什拜羊皮肤组织中均有表达。且LEF1、WNT2及YWHAZ基因在黑色绵羊皮肤中的表达量极显著高于白色绵羊皮肤(P<0.01),LEF1、WNT2及YWHAZ参与毛色的形成过程,可作为绵羊毛色潜在基因研究与毛色之间的相关性。
中图分类号:
洪文娟, 侯晨曦, 何宗龙, 决肯·阿尼瓦什. 不同毛色巴什拜羊皮肤组织中LEF1、YWHAZ及WNT2基因差异表达[J]. 新疆农业科学, 2022, 59(11): 2749-2757.
HONG Wenjuan, HOU Chenxi, HE Zonglong, Jueken Aniwashi. Expression and Regulation Analysis of LEF1, YWHAZ and WNT2 Genes in Bashibai Sheep Skins with Different Coat Colors[J]. Xinjiang Agricultural Sciences, 2022, 59(11): 2749-2757.
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | LEF1 β-actin | 29.66 26.72 | 3.46±0.50 | -2.14±0.11 | 4.66A±0.59 |
白色White | LEF1 β-actin | 29.40 23.68 | 5.40±0.64 | 1.94±0.247 | 0.43B±0.15 |
表1 LEF1基因在黑色和白色巴什拜羊皮肤中的qRT-PCR结果
Table 1 qRT-PCR results of LEF1 gene in the skin of black and white Bumbashibai sheep
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | LEF1 β-actin | 29.66 26.72 | 3.46±0.50 | -2.14±0.11 | 4.66A±0.59 |
白色White | LEF1 β-actin | 29.40 23.68 | 5.40±0.64 | 1.94±0.247 | 0.43B±0.15 |
图2 RT-PCR产物琼脂糖凝胶电泳 注:M:DL2000 DNA Marker;1~3:β-actin基因;4~8:YWHAZ基因;9~11:WNT2基因;12~14:LEF1基因
Fig.2 Agarose gel electrophoresis of qRT-PCR products Note:M:DL2000 DNA Marker; 1-3:β-actin gene; 4-8:YWHAZ gene; 9-11:WNT2 gene; 12-14:LEF1 gene
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | WNT2 β-actin | 31.67 26.72 | 6.03±0.39 | -2.38±0.35 | 7.35A±0.77 |
白色White | WNT2 β-actin | 31.37 23.68 | 7.42±0.76 | 2.39±0.66 | 0.36B±0.11 |
表2 WNT2基因在黑色和白色巴什拜羊皮肤中的qRT-PCR结果
Table 2 qRT-PCR results of WNT2 gene in the skin of black and white bashibai sheep
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | WNT2 β-actin | 31.67 26.72 | 6.03±0.39 | -2.38±0.35 | 7.35A±0.77 |
白色White | WNT2 β-actin | 31.37 23.68 | 7.42±0.76 | 2.39±0.66 | 0.36B±0.11 |
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | YWHAZ β-actin | 25.87 26.72 | 1.47±0.14 | -1.81±0.21 | 4.44A±0.57 |
白色White | YWHAZ β-actin | 26.62 23.68 | 3.27±0.40 | 0.81±0.15 | 1.02B±0.23 |
表3 YWHAZ基因在黑色和白色巴什拜羊皮肤中的qRT-PCR结果
Table 3 qRT-PCR results of YWHAZ gene in the skin of black and white Bashibai sheep
毛色 Coat colour | 基因 Gene | 平均CT值 | △CT | △△CT | 2-△△CT |
---|---|---|---|---|---|
黑色Black | YWHAZ β-actin | 25.87 26.72 | 1.47±0.14 | -1.81±0.21 | 4.44A±0.57 |
白色White | YWHAZ β-actin | 26.62 23.68 | 3.27±0.40 | 0.81±0.15 | 1.02B±0.23 |
图5 LEF1、WNT2、YWHAZ基因mRNA在不同毛色巴什拜羊皮肤中的相对表达量 注:**肩标表示差异极显著(P<0.01)
Fig.5 Relative expression levels of LEF1, WNT2 and YWHAZ mRNA in Bashibai sheep skin with different coat color Note: ** shoulder mark indicated extremely significant difference (P < 0.01)
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