新疆农业科学 ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (3): 681-689.DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2024.03.018
唐丽1(), 李春艳2, 孟紫微1, 李亚鹏1, 张王斌1()
收稿日期:
2023-07-10
出版日期:
2024-03-20
发布日期:
2024-04-19
通信作者:
张王斌(1974-),男,陕西澄城人,教授,硕士生导师,研究方向为植物病理学,(E-mail)作者简介:
唐丽(1993-),女,四川德阳人,硕士研究生,研究方向为植物病理学,(E-mail)susuzaizai@163.com
基金资助:
LI TANG1(), LI Chunyan2, MENG Ziwei1, LI Yapeng1, ZHANG Wangbin1()
Received:
2023-07-10
Online:
2024-03-20
Published:
2024-04-19
Correspondence author:
ZHANG Wangbin(1974-),male,from Chengcheng, Shanxi,professor,reaserch filed: plant pathology,(E-mail)Supported by:
摘要:
【目的】 分析新疆生产建设兵团第一师阿拉尔市库尔勒香梨园梨树腐烂病病原菌的种群分类,通过6对保守基因序列,研究库尔勒香梨腐烂病病原菌序列之间相关性及差异性。【方法】 在库尔勒香梨园内采集具有典型症状的腐烂病病样,经科赫氏法则验证获取腐烂病病原菌纯培养。采用CTAB法提取腐烂病病原菌基因组DNA,通过PCR扩增ITS、β-tubulin、EF-1α、ACT、LSU、RBP2基因并测序,利用分子系统学分析不同基因片段的系统发育关系。【结果】 在阿拉尔周边混交园内库尔勒香梨腐烂病菌种为Valsa mali var.pyri(V.ambiens、Valsa mali)。种内差异与地理位置有关,国内与国外梨腐烂病分离株差异较明显。EF-1α、ACT、LSU、RBP2在进化过程中更能够体现种间差异,系统发育树分支多,存在种间差异。【结论】 新疆生产建设兵团第一师阿拉尔市库尔勒香梨腐烂病病原菌种群分布和种间差异性,库尔勒香梨园的腐烂病病原菌主要为Valsa mali var.pyri、Valsa sordida。新疆南疆绿洲特色果园种植模式,以杨树等为主防护林最为常见,存在着林果树木腐烂病交叉侵染的可能。
中图分类号:
唐丽, 李春艳, 孟紫微, 李亚鹏, 张王斌. 梨树腐烂病病原菌种群结构分析[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(3): 681-689.
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编号 Number | 采集地点 Locality | 寄主 Host |
---|---|---|
JS-KL-4 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-KL-2 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-KL-3 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-BL-4 | 第一师九团十一连 | 巴梨 |
JT-DL-1 | 第一师九团十一连 | 砀山梨 |
JL-HZ-1 | 第一师九团六连 | 红枣 |
JL-YS-1 | 第一师九团六连 | 杨树 |
JL-YS-2 | 第一师九团六连 | 杨树 |
JL-HT-1 | 第一师九团六连 | 核桃 |
JL-KL-1 | 第一师九团六连 | 库尔勒香梨 |
JW-YS-2 | 第一师九团十五连 | 杨树 |
JW-KL-1 | 第一师九团十五连 | 库尔勒香梨 |
JW-PG-1 | 第一师九团十五连 | 苹果 |
JW-PG-2 | 第一师九团十五连 | 苹果 |
JW-KL-4 | 第一师九团十五连 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-1 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-2 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-3 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-4 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
SL-KL-1 | 第一师十六团二连 | 库尔勒香梨 |
SR-KL-2 | 第一师十二团二连 | 库尔勒香梨 |
SR-KL-1 | 第一师十二团二连 | 库尔勒香梨 |
表1 供试腐烂病菌株信息
Tab.1 Information of rot pathogen strains
编号 Number | 采集地点 Locality | 寄主 Host |
---|---|---|
JS-KL-4 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-KL-2 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-KL-3 | 第一师九团十一连 | 库尔勒香梨 |
JS-BL-4 | 第一师九团十一连 | 巴梨 |
JT-DL-1 | 第一师九团十一连 | 砀山梨 |
JL-HZ-1 | 第一师九团六连 | 红枣 |
JL-YS-1 | 第一师九团六连 | 杨树 |
JL-YS-2 | 第一师九团六连 | 杨树 |
JL-HT-1 | 第一师九团六连 | 核桃 |
JL-KL-1 | 第一师九团六连 | 库尔勒香梨 |
JW-YS-2 | 第一师九团十五连 | 杨树 |
JW-KL-1 | 第一师九团十五连 | 库尔勒香梨 |
JW-PG-1 | 第一师九团十五连 | 苹果 |
JW-PG-2 | 第一师九团十五连 | 苹果 |
JW-KL-4 | 第一师九团十五连 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-1 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-2 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-3 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
GY-KL-4 | 第一师工业园区 | 库尔勒香梨 |
SL-KL-1 | 第一师十六团二连 | 库尔勒香梨 |
SR-KL-2 | 第一师十二团二连 | 库尔勒香梨 |
SR-KL-1 | 第一师十二团二连 | 库尔勒香梨 |
基因名称 Gene Segment | 引物名称 Primer | 引物序列 Primer Sequence |
---|---|---|
核糖体基因转录间隔区(ITS) Internal transcribed spacer | ITS1 | 5’-CCGTAGGTGAACCTGCGG-3’ |
ITS4 | 5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’ | |
β-微管蛋白 β-tubulin | Bt2a | 5’-GGTAACCAATGCTGC TTTC-3’ |
Bt2b | 5’-ACCCTCAGTGTAGTGACCCTTGGC-3’ | |
延伸因子1-α(EF1-α) Extension factor 1-α | EF1-728F | 5’-CATCGAGAAGTTCGAGAAGG -3’ |
EF986R | 5’-TACTTGAAGGAACCCT TACC-3’ | |
肌动蛋白(ACT) Actin | ACT512F | 5’-ATGTGCAAGGCCGGTTTCGC-3’ |
ACT783R | 5’-TACGAGTCCTTCTGGCCCAT-3’ | |
核糖体大亚基(LSU) Ribosome large subunit | NL1 | 5’-GCT TAT CAA TAA GCG GAG GAA AGG-3’ |
NL4 | 5’GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3’ | |
RNA聚合酶第二亚基(RBP2) RNA polymerase second subunit | RBP2-5F | 5’-GATCGATCACGATGATCATCTTTCGG-3’ |
RBP2-7Cr | 5’-CCCATAGGCTTGTCTTAGCCCAT-3’ |
表2 引物名称及序列
Tab.2 Primer name and sequence
基因名称 Gene Segment | 引物名称 Primer | 引物序列 Primer Sequence |
---|---|---|
核糖体基因转录间隔区(ITS) Internal transcribed spacer | ITS1 | 5’-CCGTAGGTGAACCTGCGG-3’ |
ITS4 | 5’-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3’ | |
β-微管蛋白 β-tubulin | Bt2a | 5’-GGTAACCAATGCTGC TTTC-3’ |
Bt2b | 5’-ACCCTCAGTGTAGTGACCCTTGGC-3’ | |
延伸因子1-α(EF1-α) Extension factor 1-α | EF1-728F | 5’-CATCGAGAAGTTCGAGAAGG -3’ |
EF986R | 5’-TACTTGAAGGAACCCT TACC-3’ | |
肌动蛋白(ACT) Actin | ACT512F | 5’-ATGTGCAAGGCCGGTTTCGC-3’ |
ACT783R | 5’-TACGAGTCCTTCTGGCCCAT-3’ | |
核糖体大亚基(LSU) Ribosome large subunit | NL1 | 5’-GCT TAT CAA TAA GCG GAG GAA AGG-3’ |
NL4 | 5’GGTCCGTGTTTCAAGACGG-3’ | |
RNA聚合酶第二亚基(RBP2) RNA polymerase second subunit | RBP2-5F | 5’-GATCGATCACGATGATCATCTTTCGG-3’ |
RBP2-7Cr | 5’-CCCATAGGCTTGTCTTAGCCCAT-3’ |
编号 Number | 采集地点 Locality | 基因序列GENBANK登录号及同源性 Genbank Login Number and Homology(%) | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
ITS | β-tubulin | EF-1α | ACT | LUS | RBP2 | ||
JS-KL-4 | 第一师九团十一连 | KC840674 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (100) | MH798895 | MH015301 (98.58) | |
JS-BL-4 | 第一师九团十一连 | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (95.71) | MH015301 (98.45) | ||
GY-KL-1 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (98.21) | MN483202 (97.81) | MH013963 (98.08) | |
GY-KL-2 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (100) | MH798895 (97.70) | MH013963 (97.71) | |
JT-DL-1 | 第一师九团十一连 | JQ900358 (100) | KU710912 (98.16) | MH798895 (95.64) | MH015301 (95.45) | ||
GY-KL-3 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | KU710912 (99.68) | MH798895 (98.70) | MH015301 (100) | ||
GY-KL-4 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | KU710912 (98.16) | MH015301 (98.45) | |||
JS-KL-2 | 第九团十一连 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (96.44) | MN483202 (99.83) | MH015301 (98.33) | |
JW-KL-1 | 第一师九团十五连 | MG879502 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.39) | MH015281 (99.64) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JW-PG-1 | 第一师九团十五连 | KX196259 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | KU710988 (98.35) | MN483202 (100) | MH015301 (100) |
SL-KL-1 | 第一师十六团二连 | MG879502 (99.48%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (98.58) | MN483202 (99.83) | KU710944 (99.45) |
SR-KL-1 | 第一师十二团 | EU520048 (100%) | KC840674 (98.78) | KU710912 (99.39) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JS-KL-3 | 第一师九团十一连 | EU520048 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (99.63) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JW-YS-2 | 第一师九团十五连 | MN121756 (99.95) | MH933494 (97.73) | MN764355 (98.80) | MH015303 (98.90) | ||
SR-KL-2 | 第一师十二团二连 | KX196253 (100) | JQ900358 (100) | MH015264 (99.68) | MH015281 (99.64) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.81) |
JW-PG-2 | 第一师九团十五连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH015301 (99.48) |
JW-KL-4 | 第一师九团十五连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | MG971602 (96.54) | MH015281 (99.63) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.17) |
JL-HZ-1 | 第一师九团六连 | KJ463536 (99.83) | MN121755 (99.79) | MH933494 (98.11) | KF765722 (94.95) | MN764355 (99.83) | MH015303 (98.90) |
JL-YS-1 | 第一师九团六连 | KJ463536 (99.83) | KP117038 (100) | MH933494 (98.11) | KF765722 (98.61) | MN764355 (99.83) | MH015303 (98.90) |
JL-YS-2 | 第一师九团六连 | MN121755 (99.79) | MH933494 (97.81) | MN764355 (97.29) | MH015303 (98.90) | ||
JL-HT-1 | 第一师九团六连 | MN121755 (99.79) | MH933494 (98.11) | MN764355 (98.97) | MH015303 (98.90) | ||
JL-KL-1 | 第一师九团六连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.38) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.17) |
表3 基因序列 GenBank 登录号及同源性
Tab.3 Gene sequence GenBank accession number and homology
编号 Number | 采集地点 Locality | 基因序列GENBANK登录号及同源性 Genbank Login Number and Homology(%) | |||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
ITS | β-tubulin | EF-1α | ACT | LUS | RBP2 | ||
JS-KL-4 | 第一师九团十一连 | KC840674 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (100) | MH798895 | MH015301 (98.58) | |
JS-BL-4 | 第一师九团十一连 | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (95.71) | MH015301 (98.45) | ||
GY-KL-1 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (98.21) | MN483202 (97.81) | MH013963 (98.08) | |
GY-KL-2 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (100) | MH798895 (97.70) | MH013963 (97.71) | |
JT-DL-1 | 第一师九团十一连 | JQ900358 (100) | KU710912 (98.16) | MH798895 (95.64) | MH015301 (95.45) | ||
GY-KL-3 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | KU710912 (99.68) | MH798895 (98.70) | MH015301 (100) | ||
GY-KL-4 | 第一师工业园区 | JQ900358 (100) | KU710912 (98.16) | MH015301 (98.45) | |||
JS-KL-2 | 第九团十一连 | JQ900358 (100) | MH015264 (99.67) | MH015281 (96.44) | MN483202 (99.83) | MH015301 (98.33) | |
JW-KL-1 | 第一师九团十五连 | MG879502 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.39) | MH015281 (99.64) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JW-PG-1 | 第一师九团十五连 | KX196259 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | KU710988 (98.35) | MN483202 (100) | MH015301 (100) |
SL-KL-1 | 第一师十六团二连 | MG879502 (99.48%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (98.58) | MN483202 (99.83) | KU710944 (99.45) |
SR-KL-1 | 第一师十二团 | EU520048 (100%) | KC840674 (98.78) | KU710912 (99.39) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JS-KL-3 | 第一师九团十一连 | EU520048 (100%) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (99.63) | MN483202 (99.83) | MH015301 (100) |
JW-YS-2 | 第一师九团十五连 | MN121756 (99.95) | MH933494 (97.73) | MN764355 (98.80) | MH015303 (98.90) | ||
SR-KL-2 | 第一师十二团二连 | KX196253 (100) | JQ900358 (100) | MH015264 (99.68) | MH015281 (99.64) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.81) |
JW-PG-2 | 第一师九团十五连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.69) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH015301 (99.48) |
JW-KL-4 | 第一师九团十五连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | MG971602 (96.54) | MH015281 (99.63) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.17) |
JL-HZ-1 | 第一师九团六连 | KJ463536 (99.83) | MN121755 (99.79) | MH933494 (98.11) | KF765722 (94.95) | MN764355 (99.83) | MH015303 (98.90) |
JL-YS-1 | 第一师九团六连 | KJ463536 (99.83) | KP117038 (100) | MH933494 (98.11) | KF765722 (98.61) | MN764355 (99.83) | MH015303 (98.90) |
JL-YS-2 | 第一师九团六连 | MN121755 (99.79) | MH933494 (97.81) | MN764355 (97.29) | MH015303 (98.90) | ||
JL-HT-1 | 第一师九团六连 | MN121755 (99.79) | MH933494 (98.11) | MN764355 (98.97) | MH015303 (98.90) | ||
JL-KL-1 | 第一师九团六连 | EU520048 (100) | JQ900358 (100) | KU710912 (99.38) | MH015281 (100) | MN483202 (99.83) | MH013963 (97.17) |
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