梭梭HaACT基因片段的克隆和3'UTR序列分析

Cloning of Fragment of HaACT and 3' UTR Analysis

  • 摘要: 目的以克隆HaACT基因为出发点,为进一步分析其表达特点奠定基础.方法根据NCBI上已发表的藜科其他植物肌动蛋白(Actin)序列的保守区设计一对简并性引物,以梭梭(Haloxylon ammodendron)同化枝为材料提取总RNA,采用RT-PCR法和3'RACE技术克隆了HaACT基因部分片段及3'UTR序列.结果得到HaACT基因片段1 107 bp,该序列编码257个氨基酸,3'UTR序列长度为416 bp.使用NCBI和DNAMAN软件对3'UTR序列进行了同源性分析.HaACT基因3'UTR序列与CaACT基因3'UTR序列的相似性高达93;,与BvACT基因3'UTR序列相似性为92;,与GhACT基因3'UTR序列相似性最低,为86;.结论HaACT基因与其他植物Actin基因可能具有相似的调控机制.

     

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