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Cloning and Bioinformatics Analysis of High Photosynthetic Gene ppdk in Zea Mays

WANG Zhong;ZHANG Yue-qiang;FAN Zhe-ru;LI Jian-feng;ZHAO Qi;WANG Zi-xia;Haireguli·Abulizi;ZHANG Hong-zhi   

  • Received:2010-12-25 Revised:2010-12-25 Online:2010-12-25 Published:2010-12-25

玉米高光效基因ppdk的克隆及其生物信息学分析

王重;张跃强;樊哲儒;李剑峰;赵奇;王子霞;海热古丽·阿不力孜;张宏芝   

  1. 新疆农业科学院核技术生物技术研究所,乌鲁木齐,830091

摘要: [目的]获得玉米(Zea mays)的丙酮酸磷酸双激酶基因(以下简称ppdk),并对其进行生物信息学分析.[方法]使用Trizol提取玉米SC704的总RNA,并用特异引物对其进行RT-PCR扩增,将得到的cDNA片段连接到pGEM-T载体后转化大肠杆菌DH5α,然后对阳性克隆进行测序,并对序列进行生物信息学分析.[结果]获得的玉米PPDK基因CDS全长2781bp,与玉米z561ppdk基因同源性为99;;其编码的多肽链包含926个氨基酸,与玉米PPDK同源性为97;.[结论]克隆了玉米C4型丙酮酸磷酸双激酶(PPDK)基因,它所编码的氨基酸序列具备PPDK蛋白的保守序列和催化活性中心区域.该基因的成功克隆为今后利用其改造C3植物的光合效率以提高粮食单产奠定了良好的基础.