摘要： [目的]选取3个马匹品种(柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马),对其5个微卫星DNA座位AHT4、ASB2、HMS3、HMS7、LEX3进行多态性分析,利用SPASS分析软件,对3个马品种进行初步鉴别.[方法]以柯尔克孜马、俄罗斯速步马、纯血马为实验对象,分别采集血样10 mL,枸橼酸钠抗凝,实验室中对所选取的5个微卫星DNA座位进行非变性丙烯酰胺电泳(PAGE)检测,用Popgene32分析数据.比较品种间有效等位基因数(Ne)、等位基因频数分布间的差异,辅以各品种特有的基因型条带对三个马品种进行初步鉴别.[结果]对5个微卫星标记的有效等位基因数(Ne)数值进行分析,发现纯血马与俄罗斯速步马、柯尔克孜马与俄罗斯速步马呈显著差异关系(P＜0.05),成为初步鉴别三个马品种的重要依据;对5个微卫星标记进行非变性丙烯酰胺电泳(PAGE)检测,发现ASB2微卫星标记的基因型中,柯尔克孜马有区别于其他两个品种马的基因型:CC、CD、EG、EH基因型,纯血马所特有的基因型为BI、JJ、KK基因型;AHT4微卫星标记的等位基因型中,柯尔克孜马所特有的基因型为DF、EF、GG基因型,纯血马所特有的基因型为BC基因型;HMS3微卫星标记的等位基因型中,纯血马所特有的基因型为CC基因型;HMS7微卫星标记的等位基因型中,纯血马所特有的基因型为AA基因型.[结论]3个马品种的鉴别可以通过筛选出的微卫星位点的有效等位基因数(Ne),以及所选微卫星标记的等位基因,辅以各品种特异的基因型电泳条带,从而达到初步鉴别三个马匹品种的目的.