新疆农业科学 ›› 2024, Vol. 61 ›› Issue (11): 2614-2625.DOI: 10.6048/j.issn.1001-4330.2024.11.002
• 种质资源·分子遗传学·生理生化·微生物 • 上一篇 下一篇
李超(), 杨英, 郑贺云, 杨建丽, 陈伟, 杨咪, 孙玉萍(
)
收稿日期:
2024-05-25
出版日期:
2024-11-20
发布日期:
2025-01-08
通信作者:
孙玉萍(1979 -),女,甘肃人,研究员,研究方向为西甜瓜育种,(E-mail)1501218842@qq.com作者简介:
李超(1985-),男,陕西人,副研究员,硕士,研究方向为西甜瓜育种,(E-mail)lclxblc@126.com
基金资助:
LI Chao(), YANG Ying, ZHENG Heyun, YANG Jianli, CHEN Wei, YANG Mi, SUN Yuping(
)
Received:
2024-05-25
Published:
2024-11-20
Online:
2025-01-08
Supported by:
摘要:
【目的】分析新疆甜瓜种质资源的遗传多样性与群体结构,为甜瓜种质资源收集、遗传改良和高效利用提供理论基础。【方法】选取甜瓜种质182份,利用152对SSR引物对其进行检测。筛选出19对多态性较高的引物,利用TP-M13-SSR分子标记分析182份新疆甜瓜种质材料的遗传多样性,并根据Nei's遗传距离(D)进行聚类分析,以Structure软件的混合模型聚类法分析其群体遗传结构。【结果】SSR标记共检测到160个等位基因,等位基因数(Na)的变化幅度为3~16个,平均每对引物8.421 1个,有效等位基因数(Ne)的变化幅度为1.092 0~6.087 9,平均为3.077 0;观测杂合度(Ho)为0.011 0~1.000 0,平均0.309 7;期望杂合度(He)为0.084 5~0.838 0,平均为0.599 1;香农信息指数(I)范围为0.190 6~2.061 3,平均为1.239 9;各位点的多态性信息含量(PIC)为0.081 1~0.815 8,平均为0.555 8,大多数位点表现为高度多态性。182份甜瓜种质材料被分为两大亚群,亚群Ⅰ为88份甜瓜种质材料,亚群Ⅱ为94份甜瓜材料。当K=2时,ΔK出现明显的峰值,182份甜瓜种质材料分为2个亚群较为合适,且存在过度的纯合性。【结论】新疆甜瓜种质资源遗传多样性较为丰富,但与传统4个变种的品种群分类结果不同。新疆甜瓜种质资源可分为两大亚群,群体中纯合个体较多,但其他杂合个体间存在一定的基因交流。
中图分类号:
李超, 杨英, 郑贺云, 杨建丽, 陈伟, 杨咪, 孙玉萍. 基于SSR荧光标记分析新疆甜瓜种质资源遗传多样性与群体结构[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(11): 2614-2625.
LI Chao, YANG Ying, ZHENG Heyun, YANG Jianli, CHEN Wei, YANG Mi, SUN Yuping. Genetic diversity and population structure analysis of melon germplasm resources in Xinjiang based on SSR fluorescence markers[J]. Xinjiang Agricultural Sciences, 2024, 61(11): 2614-2625.
编号 Code | 品种名称 Varieties name | 来源 Origin |
---|---|---|
1 | 赛热克可口奇(1) | 和田市 |
2 | 连木沁白瓜 | 吐鲁番市 |
3 | 黄花皮白肉蜜极甘 | 吐鲁番市 |
4 | 密极甘红肉 | 吐鲁番市 |
5 | 绿棒子 | 吐鲁番市 |
6 | 秋黄皮白肉 | 鄯善县 |
7 | 歪把子密极甘 | 吐鲁番市 |
8 | 小青皮(1) | 吐鲁番市 |
9 | 奎克托拉 | 伽师县 |
10 | 其甘吐木休克阿合奇 | 皮山县 |
11 | 黄皮金棒子 | 吐鲁番市 |
12 | 包子可口奇(1) | 麦盖提县 |
13 | 塔河早 | 鄯善县 |
14 | 胜金白瓜 | 吐鲁番市 |
15 | 黑眉毛蜜极甘(1) | 吐鲁番市 |
16 | 努拉伊 | 皮山县 |
17 | 苏白皮 | 阿拉尔市 |
18 | 阿克拉瓦提(1) | 且末县 |
19 | 阿克卡潘 | 且末县 |
20 | 青皮红肉 | 阿拉尔市 |
21 | 赛热克可口奇(2) | 库尔勒市 |
22 | 其里甘(1)A | 伊宁市 |
23 | 本地黄皮子 | 吐鲁番市 |
24 | 跃进黄皮 | 吐鲁番市 |
25 | 辟山 | 伽师县 |
26 | 乌兹别克斯坦 | / |
27 | 红9号 | 乌鲁木齐市 |
28 | 大黄旦子A | 塔城市 |
29 | 小青皮红肉 | 阿拉尔市 |
30 | 花皮金棒子 | 吐鲁番市 |
31 | 7831 | 乌鲁木齐市 |
32 | 黄皮白肉 | 鄯善县 |
33 | 木吉可口奇 | 皮山县 |
34 | 恰尔库洪(1) | 尉犁县 |
35 | 香梨黄 | 吐鲁番市 |
36 | 圆球密极甘 | / |
37 | 毛毛红 | 阿拉尔市 |
38 | 阿比那瓦提 | 伊宁市 |
39 | 卡热卡来克可口奇 | 皮山县 |
40 | 黑冬瓜 | 鄯善县 |
41 | 8623 | 阿勒泰市 |
42 | 鸡旦黄 | 鄯善县 |
43 | 炮弹 | 鄯善县 |
44 | 炮台红 | 第八师121团 |
45 | 青皮白肉可口奇 | 伊宁县 |
46 | 塔城冬甜瓜 | 塔城市 |
47 | 一窝旦 | 哈密市 |
48 | 黄金龙 | 吐鲁番市 |
49 | 卡拉尕西(1) | 疏附县 |
50 | 伊里拉Yilali | 皮山县 |
51 | 白冬瓜 | 鄯善县 |
52 | 阿合甫提 | 麦盖提县 |
53 | 赛热克麦盖 | 于田县 |
54 | 乌热力 | 麦盖提县 |
55 | 青皮红肉可口奇 | 第二师36团 |
56 | 阿克拉瓦提(2) | 伊宁市 |
57 | 赛热克库洪 | 精河县 |
58 | 于田冬瓜 | 和田市 |
59 | 青皮青肉瓜旦子A | 吐鲁番市 |
60 | 乌热可洪(麻) | 新和县 |
61 | 且末可口奇(1) | 和田市 |
62 | 青麻皮 | 精河县 |
63 | 可口奇 | 伊宁县 |
64 | 热瓜旦A | 哈密市 |
65 | 纳西甘(1) | 库车市 |
66 | 阿克奇 | 和田市 |
67 | 伯谢克辛(1)C | 尉犁县 |
68 | 阿克可口奇(1) | 库尔勒市 |
69 | 青皮红肉冬瓜(1) | 吐鲁番市 |
70 | 马木提卡孜 | 麦盖提县 |
71 | 恰尔库洪(2) | 库尔勒市 |
72 | 赛热克可口奇(3) | 洛浦县 |
73 | 奎克维尔(1) | 库车市 |
74 | 奎克拜尔 | 伽师县 |
75 | 泰热(1) | 且末县 |
76 | 且末可口奇(2) | 和田市 |
77 | 伯谢克辛(2)C | 和田县 |
78 | 赛热克泰热(1) | 策勒县 |
79 | 阿克其 | 和田市 |
80 | 纳西甘(2) | 岳普湖县 |
81 | 卡拉克赛(1) | 新和县 |
82 | 秋黄皮红肉 | 吐鲁番市 |
83 | 恰尔库洪(3) | 岳普湖县 |
84 | 阿克拉瓦提(3) | 尉犁县 |
85 | 赛热克可口奇(4) | 策勒县 |
86 | 波斯皮牙孜(1) | 伽师县 |
87 | 卡拉可口奇(1) | 伽师县 |
88 | 卡拉麦盖(1) | 策勒县 |
89 | 卡拉麦盖(2) | 皮山县 |
90 | 包子可口奇(2) | 皮山县 |
91 | 奎瑞克 | 皮山县 |
92 | 赛热克可口奇(5) | 且末县 |
93 | 青皮白肉冬瓜(1) | 吐鲁番市 |
94 | 铁皮(1) | 第二师34团 |
95 | 卡拉其里甘A | 伽师县 |
96 | 赛热克吐木休克 | 皮山县 |
97 | 安江可口奇 | 新和县 |
98 | 恰克恰克黄皮红肉秋瓜 | 吐鲁番市 |
99 | 哈曼其(1) | 伽师县 |
100 | 奎克苏依曼 | 且末县 |
101 | 未子瓜 | 吐鲁番市 |
102 | 小青皮(2) | 鄯善县 |
103 | 野甜瓜(1) | 吐鲁番市 |
104 | 青皮青肉冬瓜 | 吐鲁番市 |
105 | 青皮红肉冬瓜(2) | 鄯善县 |
106 | 青皮脆 | 阿拉尔市 |
107 | 一包糖 | 吐鲁番市 |
108 | 绿皮酥 | 阿拉尔市 |
109 | 白皮脆 | 伽师县 |
110 | 纳西甘(3) | 库尔勒市 |
111 | 俄罗斯可洪 | 尉犁县 |
112 | 八一香梨 | 第二师34团 |
113 | 洋海白瓜 | 吐鲁番市 |
114 | 纳西甘(4) | 和田市 |
115 | 泰热(2) | 麦盖提县 |
116 | 阿克可口奇(2) | 伊宁市 |
117 | 本地白瓜 | 尉犁县 |
118 | 35号母本 | 阿勒泰市 |
119 | 网纹香(变异) | 第六师103团 |
120 | 网纹麦盖 | 策勒县 |
121 | 大黄盖 | 鄯善县 |
122 | 卡拉麦盖(3) | 和田市 |
123 | 恰尔蜜极甘 | 吐鲁番市 |
124 | 巴楚留香瓜 | 巴楚县 |
125 | 加格达(1) | 哈密市 |
126 | 黄皮红肉夏瓜 | 鄯善县 |
127 | 加格达(2) | 且末县 |
128 | 艾孜Aizi | 且末县 |
129 | 青皮白肉冬瓜(2) | 鄯善县 |
130 | 阿克伯克扎德 | 吐鲁番市 |
131 | 恰尔可口奇 | 且末县 |
132 | 奎克维尔(2) | 新和县 |
133 | 奎孜力克焦孜 | 伽师县 |
134 | 炮弹白 | 吐鲁番市 |
135 | 野甜瓜(2) | 鄯善县 |
136 | 黑眉毛蜜极甘(2) | 鄯善县 |
137 | 玛纳斯瓜旦A | 吐鲁番市 |
138 | 网纹铁皮 | 第六师103团 |
139 | 黄皮红肉秋瓜 | 托克逊县 |
140 | 黄麻皮 | 第十二师222团 |
141 | 阿拉伯克扎德 | 吐鲁番市 |
142 | 网纹香 | 鄯善县 |
143 | 其里甘(2)A | 尉犁县 |
144 | 赛热克克西力克可洪 | 伊宁市 |
145 | 赛热克可口奇(6) | 于田县 |
146 | 巴登 | 吐鲁番市 |
147 | 红心脆 | 吐鲁番市 |
148 | 赛热克泰热(2) | 和田市 |
149 | 阿克苏依曼 | 岳普湖县 |
150 | 白皮可口奇 | 伊宁县 |
151 | 皮极甘 | 和田市 |
152 | 绿皮子 | 吐鲁番市 |
153 | 卡拉尕西(2) | 温宿县 |
154 | 厚黄皮 | 吐鲁番市 |
155 | 红肉可口奇 | 鄯善县 |
156 | 红23系含笑 | 鄯善县 |
157 | 冬瓜 | 若羌县 |
158 | 阿拉格尔 | 岳普湖县 |
159 | 赛热克可口奇(7) | 尉犁县 |
160 | 阿克吐木休克 | 麦盖提县 |
161 | 铁千里 | 第七师35团 |
162 | 白兰瓜C | 第十二师222团 |
163 | 黑巴登 | 吐鲁番市 |
164 | 铁皮(2) | 疏附县 |
165 | 塔石可洪A | 伊宁市 |
166 | 黄旦子(女庄园)A | 昌吉市 |
167 | 苏光黄 | 第七师126团 |
168 | 卡拉克赛(2) | 伽师县 |
169 | 波斯皮牙孜(2) | 且末县 |
170 | 卡拉可口奇(2) | 且末县 |
171 | 光皮胜金白瓜 | 鄯善县 |
172 | 茉莉Moli | 吐鲁番市 |
173 | 加格达(3) | 尉犁县 |
174 | 泰热(3) | 皮山县 |
175 | 白巴登 | / |
176 | 伯谢克辛(3)C | 伽师县 |
177 | 阿克可口奇(3) | 吐鲁番市 |
178 | 卡拉可口奇(3) | 疏附县 |
179 | 哈曼其(2) | 岳普湖县 |
180 | 波斯皮牙孜(3) | 库尔勒市 |
181 | 波斯皮牙孜(4) | 尉犁县 |
182 | 泰热(4) | 尉犁县 |
表1 182份新疆甜瓜种质材料
Tab.1 182 melon germplasm materials in Xinjiang
编号 Code | 品种名称 Varieties name | 来源 Origin |
---|---|---|
1 | 赛热克可口奇(1) | 和田市 |
2 | 连木沁白瓜 | 吐鲁番市 |
3 | 黄花皮白肉蜜极甘 | 吐鲁番市 |
4 | 密极甘红肉 | 吐鲁番市 |
5 | 绿棒子 | 吐鲁番市 |
6 | 秋黄皮白肉 | 鄯善县 |
7 | 歪把子密极甘 | 吐鲁番市 |
8 | 小青皮(1) | 吐鲁番市 |
9 | 奎克托拉 | 伽师县 |
10 | 其甘吐木休克阿合奇 | 皮山县 |
11 | 黄皮金棒子 | 吐鲁番市 |
12 | 包子可口奇(1) | 麦盖提县 |
13 | 塔河早 | 鄯善县 |
14 | 胜金白瓜 | 吐鲁番市 |
15 | 黑眉毛蜜极甘(1) | 吐鲁番市 |
16 | 努拉伊 | 皮山县 |
17 | 苏白皮 | 阿拉尔市 |
18 | 阿克拉瓦提(1) | 且末县 |
19 | 阿克卡潘 | 且末县 |
20 | 青皮红肉 | 阿拉尔市 |
21 | 赛热克可口奇(2) | 库尔勒市 |
22 | 其里甘(1)A | 伊宁市 |
23 | 本地黄皮子 | 吐鲁番市 |
24 | 跃进黄皮 | 吐鲁番市 |
25 | 辟山 | 伽师县 |
26 | 乌兹别克斯坦 | / |
27 | 红9号 | 乌鲁木齐市 |
28 | 大黄旦子A | 塔城市 |
29 | 小青皮红肉 | 阿拉尔市 |
30 | 花皮金棒子 | 吐鲁番市 |
31 | 7831 | 乌鲁木齐市 |
32 | 黄皮白肉 | 鄯善县 |
33 | 木吉可口奇 | 皮山县 |
34 | 恰尔库洪(1) | 尉犁县 |
35 | 香梨黄 | 吐鲁番市 |
36 | 圆球密极甘 | / |
37 | 毛毛红 | 阿拉尔市 |
38 | 阿比那瓦提 | 伊宁市 |
39 | 卡热卡来克可口奇 | 皮山县 |
40 | 黑冬瓜 | 鄯善县 |
41 | 8623 | 阿勒泰市 |
42 | 鸡旦黄 | 鄯善县 |
43 | 炮弹 | 鄯善县 |
44 | 炮台红 | 第八师121团 |
45 | 青皮白肉可口奇 | 伊宁县 |
46 | 塔城冬甜瓜 | 塔城市 |
47 | 一窝旦 | 哈密市 |
48 | 黄金龙 | 吐鲁番市 |
49 | 卡拉尕西(1) | 疏附县 |
50 | 伊里拉Yilali | 皮山县 |
51 | 白冬瓜 | 鄯善县 |
52 | 阿合甫提 | 麦盖提县 |
53 | 赛热克麦盖 | 于田县 |
54 | 乌热力 | 麦盖提县 |
55 | 青皮红肉可口奇 | 第二师36团 |
56 | 阿克拉瓦提(2) | 伊宁市 |
57 | 赛热克库洪 | 精河县 |
58 | 于田冬瓜 | 和田市 |
59 | 青皮青肉瓜旦子A | 吐鲁番市 |
60 | 乌热可洪(麻) | 新和县 |
61 | 且末可口奇(1) | 和田市 |
62 | 青麻皮 | 精河县 |
63 | 可口奇 | 伊宁县 |
64 | 热瓜旦A | 哈密市 |
65 | 纳西甘(1) | 库车市 |
66 | 阿克奇 | 和田市 |
67 | 伯谢克辛(1)C | 尉犁县 |
68 | 阿克可口奇(1) | 库尔勒市 |
69 | 青皮红肉冬瓜(1) | 吐鲁番市 |
70 | 马木提卡孜 | 麦盖提县 |
71 | 恰尔库洪(2) | 库尔勒市 |
72 | 赛热克可口奇(3) | 洛浦县 |
73 | 奎克维尔(1) | 库车市 |
74 | 奎克拜尔 | 伽师县 |
75 | 泰热(1) | 且末县 |
76 | 且末可口奇(2) | 和田市 |
77 | 伯谢克辛(2)C | 和田县 |
78 | 赛热克泰热(1) | 策勒县 |
79 | 阿克其 | 和田市 |
80 | 纳西甘(2) | 岳普湖县 |
81 | 卡拉克赛(1) | 新和县 |
82 | 秋黄皮红肉 | 吐鲁番市 |
83 | 恰尔库洪(3) | 岳普湖县 |
84 | 阿克拉瓦提(3) | 尉犁县 |
85 | 赛热克可口奇(4) | 策勒县 |
86 | 波斯皮牙孜(1) | 伽师县 |
87 | 卡拉可口奇(1) | 伽师县 |
88 | 卡拉麦盖(1) | 策勒县 |
89 | 卡拉麦盖(2) | 皮山县 |
90 | 包子可口奇(2) | 皮山县 |
91 | 奎瑞克 | 皮山县 |
92 | 赛热克可口奇(5) | 且末县 |
93 | 青皮白肉冬瓜(1) | 吐鲁番市 |
94 | 铁皮(1) | 第二师34团 |
95 | 卡拉其里甘A | 伽师县 |
96 | 赛热克吐木休克 | 皮山县 |
97 | 安江可口奇 | 新和县 |
98 | 恰克恰克黄皮红肉秋瓜 | 吐鲁番市 |
99 | 哈曼其(1) | 伽师县 |
100 | 奎克苏依曼 | 且末县 |
101 | 未子瓜 | 吐鲁番市 |
102 | 小青皮(2) | 鄯善县 |
103 | 野甜瓜(1) | 吐鲁番市 |
104 | 青皮青肉冬瓜 | 吐鲁番市 |
105 | 青皮红肉冬瓜(2) | 鄯善县 |
106 | 青皮脆 | 阿拉尔市 |
107 | 一包糖 | 吐鲁番市 |
108 | 绿皮酥 | 阿拉尔市 |
109 | 白皮脆 | 伽师县 |
110 | 纳西甘(3) | 库尔勒市 |
111 | 俄罗斯可洪 | 尉犁县 |
112 | 八一香梨 | 第二师34团 |
113 | 洋海白瓜 | 吐鲁番市 |
114 | 纳西甘(4) | 和田市 |
115 | 泰热(2) | 麦盖提县 |
116 | 阿克可口奇(2) | 伊宁市 |
117 | 本地白瓜 | 尉犁县 |
118 | 35号母本 | 阿勒泰市 |
119 | 网纹香(变异) | 第六师103团 |
120 | 网纹麦盖 | 策勒县 |
121 | 大黄盖 | 鄯善县 |
122 | 卡拉麦盖(3) | 和田市 |
123 | 恰尔蜜极甘 | 吐鲁番市 |
124 | 巴楚留香瓜 | 巴楚县 |
125 | 加格达(1) | 哈密市 |
126 | 黄皮红肉夏瓜 | 鄯善县 |
127 | 加格达(2) | 且末县 |
128 | 艾孜Aizi | 且末县 |
129 | 青皮白肉冬瓜(2) | 鄯善县 |
130 | 阿克伯克扎德 | 吐鲁番市 |
131 | 恰尔可口奇 | 且末县 |
132 | 奎克维尔(2) | 新和县 |
133 | 奎孜力克焦孜 | 伽师县 |
134 | 炮弹白 | 吐鲁番市 |
135 | 野甜瓜(2) | 鄯善县 |
136 | 黑眉毛蜜极甘(2) | 鄯善县 |
137 | 玛纳斯瓜旦A | 吐鲁番市 |
138 | 网纹铁皮 | 第六师103团 |
139 | 黄皮红肉秋瓜 | 托克逊县 |
140 | 黄麻皮 | 第十二师222团 |
141 | 阿拉伯克扎德 | 吐鲁番市 |
142 | 网纹香 | 鄯善县 |
143 | 其里甘(2)A | 尉犁县 |
144 | 赛热克克西力克可洪 | 伊宁市 |
145 | 赛热克可口奇(6) | 于田县 |
146 | 巴登 | 吐鲁番市 |
147 | 红心脆 | 吐鲁番市 |
148 | 赛热克泰热(2) | 和田市 |
149 | 阿克苏依曼 | 岳普湖县 |
150 | 白皮可口奇 | 伊宁县 |
151 | 皮极甘 | 和田市 |
152 | 绿皮子 | 吐鲁番市 |
153 | 卡拉尕西(2) | 温宿县 |
154 | 厚黄皮 | 吐鲁番市 |
155 | 红肉可口奇 | 鄯善县 |
156 | 红23系含笑 | 鄯善县 |
157 | 冬瓜 | 若羌县 |
158 | 阿拉格尔 | 岳普湖县 |
159 | 赛热克可口奇(7) | 尉犁县 |
160 | 阿克吐木休克 | 麦盖提县 |
161 | 铁千里 | 第七师35团 |
162 | 白兰瓜C | 第十二师222团 |
163 | 黑巴登 | 吐鲁番市 |
164 | 铁皮(2) | 疏附县 |
165 | 塔石可洪A | 伊宁市 |
166 | 黄旦子(女庄园)A | 昌吉市 |
167 | 苏光黄 | 第七师126团 |
168 | 卡拉克赛(2) | 伽师县 |
169 | 波斯皮牙孜(2) | 且末县 |
170 | 卡拉可口奇(2) | 且末县 |
171 | 光皮胜金白瓜 | 鄯善县 |
172 | 茉莉Moli | 吐鲁番市 |
173 | 加格达(3) | 尉犁县 |
174 | 泰热(3) | 皮山县 |
175 | 白巴登 | / |
176 | 伯谢克辛(3)C | 伽师县 |
177 | 阿克可口奇(3) | 吐鲁番市 |
178 | 卡拉可口奇(3) | 疏附县 |
179 | 哈曼其(2) | 岳普湖县 |
180 | 波斯皮牙孜(3) | 库尔勒市 |
181 | 波斯皮牙孜(4) | 尉犁县 |
182 | 泰热(4) | 尉犁县 |
引物名称 Primer name | 正向引物 Forward primer sequence | 反向引物 Reverse primer sequence | 荧光标记 Fluorescence labeling | 基序 Motif | 大小 Size | 位置 LG |
---|---|---|---|---|---|---|
CMTCN50 | TCTACTTCCATGAATCCATC | TAGAATGGTTAGGAAACCCT | 6-FAM | (TC)16(TA)12 | 114-132 | 6 |
CMBR002 | TGCAAATATTGTGAAGGCGA | AATCCCCACTTGTTGGTTTG | 6-FAM | (AG)22 | 251-269 | 4 |
CMMS004 | GCCCAACGGACACACTCACTCACAC | GAGGGAGTAAGAATAAGAAGAAGAA | HEX | (GA)16(GA)12 | 185-203 | 7 |
CMTCN30 | GGAGGGAAAGGAAAGAGAGA | GGCAAGAAGATGGCAAAGAT | HEX | (TC)13 | 193-207 | 7 |
CMCAN90 | CTAACGCTGACCCAACTCTC | GTGGTTGTGAGTTATGAGGAG | 6-FAM | (TA)5TC(CA)5T(AC)2 | 122-128 | 7 |
CMCTN7 | AATGACACTGCCCACATTCT | AGGTTTTTCAATGGAGGGGA | 6-FAM | (CT)20 | 106-126 | 9 |
CMN53_72A | TTTTGGTTTGGAGGGAGTTG | TGCCGCTGATTATATGTTGG | HEX | / | 174-189 | 9 |
CMCTN71 | TCAATTTTTGCCAAACAAGC | CAAGGACACAGATTTAATAC | 6-FAM | (CT)11 | 160-210 | 10 |
CMATN89 | CACTACCTTAAAACAGAATTG | GGACAATTTAGGGAGGATC | 6-FAM | (AT)13A(AT)2 | 141-163 | 11 |
CMGA104 | TTACTGGGTTTTGCCGATTT | AATTCCGTATTCAACTCTCC | TAMRA | (GA)14 | 127-133 | 11 |
CMGAN80 | ATATTGATTGCTGGGAAAGG | CTTTTTTGGCTTTATTGGGTC | TAMRA | (GA)2TG(GA)14TCT(CCTTT)6 | 148-160 | 12 |
CMAGN33 | CTGTCTGCTATTCTCCACTTGG | TGTATGCCACGTAGCGAAAC | TAMRA | (AG)2AA(AG)8TT(GA)3 | 116-174 | 12 |
CMTCN6 | GCATTGCTCGATCAGTTTTAC | ACTCCGTCAAGATCCCAAAA | TAMRA | (TC)2TT(TC)16 | 144-162 | 4 |
CSCT335 | CCTTCACTTCCATCTTCATC | CGGTCCTTCATTTCATAGAC | TAMRA | (CT)8N4(CT)11 | 88-114 | 6 |
CMGAN21 | GCTGTAAAACGAAACGGAGA | CGATCTTCTTTATTCTTCGCC | HEX | / | 133-153 | 7 |
SSR12083 | GAATTGGCCCATCCTTCATT | GCCATTCCAAAAACTTTTCAAC | HEX | / | 114-140 | 11 |
PM4 | TTACTGGGTTTTGCCGATTT | AATTCCGTATTCAACTCTCC | TAMRA | / | 125-133 | 11 |
SSR04632 | ACTCCGTTTGGTGGTTTTTG | TCCCAATTCCATAGCAGAGG | HEX | / | 147-165 | 4 |
C30 | CTGTCTGCTATTCTC CACTTGG | TGTATGCCACGTAGCGAAAC | HEX | / | 112-190 | 12 |
表2 19对SSR引物的筛选
Tab.2 Screening of 19 SSR primers
引物名称 Primer name | 正向引物 Forward primer sequence | 反向引物 Reverse primer sequence | 荧光标记 Fluorescence labeling | 基序 Motif | 大小 Size | 位置 LG |
---|---|---|---|---|---|---|
CMTCN50 | TCTACTTCCATGAATCCATC | TAGAATGGTTAGGAAACCCT | 6-FAM | (TC)16(TA)12 | 114-132 | 6 |
CMBR002 | TGCAAATATTGTGAAGGCGA | AATCCCCACTTGTTGGTTTG | 6-FAM | (AG)22 | 251-269 | 4 |
CMMS004 | GCCCAACGGACACACTCACTCACAC | GAGGGAGTAAGAATAAGAAGAAGAA | HEX | (GA)16(GA)12 | 185-203 | 7 |
CMTCN30 | GGAGGGAAAGGAAAGAGAGA | GGCAAGAAGATGGCAAAGAT | HEX | (TC)13 | 193-207 | 7 |
CMCAN90 | CTAACGCTGACCCAACTCTC | GTGGTTGTGAGTTATGAGGAG | 6-FAM | (TA)5TC(CA)5T(AC)2 | 122-128 | 7 |
CMCTN7 | AATGACACTGCCCACATTCT | AGGTTTTTCAATGGAGGGGA | 6-FAM | (CT)20 | 106-126 | 9 |
CMN53_72A | TTTTGGTTTGGAGGGAGTTG | TGCCGCTGATTATATGTTGG | HEX | / | 174-189 | 9 |
CMCTN71 | TCAATTTTTGCCAAACAAGC | CAAGGACACAGATTTAATAC | 6-FAM | (CT)11 | 160-210 | 10 |
CMATN89 | CACTACCTTAAAACAGAATTG | GGACAATTTAGGGAGGATC | 6-FAM | (AT)13A(AT)2 | 141-163 | 11 |
CMGA104 | TTACTGGGTTTTGCCGATTT | AATTCCGTATTCAACTCTCC | TAMRA | (GA)14 | 127-133 | 11 |
CMGAN80 | ATATTGATTGCTGGGAAAGG | CTTTTTTGGCTTTATTGGGTC | TAMRA | (GA)2TG(GA)14TCT(CCTTT)6 | 148-160 | 12 |
CMAGN33 | CTGTCTGCTATTCTCCACTTGG | TGTATGCCACGTAGCGAAAC | TAMRA | (AG)2AA(AG)8TT(GA)3 | 116-174 | 12 |
CMTCN6 | GCATTGCTCGATCAGTTTTAC | ACTCCGTCAAGATCCCAAAA | TAMRA | (TC)2TT(TC)16 | 144-162 | 4 |
CSCT335 | CCTTCACTTCCATCTTCATC | CGGTCCTTCATTTCATAGAC | TAMRA | (CT)8N4(CT)11 | 88-114 | 6 |
CMGAN21 | GCTGTAAAACGAAACGGAGA | CGATCTTCTTTATTCTTCGCC | HEX | / | 133-153 | 7 |
SSR12083 | GAATTGGCCCATCCTTCATT | GCCATTCCAAAAACTTTTCAAC | HEX | / | 114-140 | 11 |
PM4 | TTACTGGGTTTTGCCGATTT | AATTCCGTATTCAACTCTCC | TAMRA | / | 125-133 | 11 |
SSR04632 | ACTCCGTTTGGTGGTTTTTG | TCCCAATTCCATAGCAGAGG | HEX | / | 147-165 | 4 |
C30 | CTGTCTGCTATTCTC CACTTGG | TGTATGCCACGTAGCGAAAC | HEX | / | 112-190 | 12 |
图1 3份甜瓜材料在荧光标记SSR12083位点上的等位变异峰 注:品种赛热可口奇在该位点检测到了2个等位变异。纵坐标表示荧光信号强度;横坐标表示3个不同的扩增片段大小(bp)
Fig.1 Allelic variation peaks of three melon materials at fluorescence labeled SSR12083 locus Notes: Two allelic variations were detected at this locus in the variety Saire Kekou Qi.The vertical axis represents the fluorescence signal intensity; The horizontal axis represents three different amplified fragment sizes (bp)
引物 Primers | 观察等位 基因数 Na | 有效等位 基因数 Ne | 观测杂 合度Ho | 期望杂 合度He | 遗传距 离D | 遗传分化 系数Fst | Shannon's 指数I | 多态性信息 含量PIC | 基因流 Nm |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C30 | 11 | 3.209 4 | 0.373 6 | 0.690 3 | 0.688 4 | 0.728 6 | 1.460 4 | 0.653 7 | 0.093 1 |
CMAGN33 | 13 | 2.898 2 | 0.142 9 | 0.656 8 | 0.655 0 | 0.890 9 | 1.292 2 | 0.592 1 | 0.030 6 |
CMATN89 | 16 | 6.087 9 | 0.054 9 | 0.838 0 | 0.835 7 | 0.967 1 | 2.061 3 | 0.815 8 | 0.008 5 |
CMBR002 | 9 | 2.155 7 | 0.044 0 | 0.537 6 | 0.536 1 | 0.959 0 | 1.075 2 | 0.493 0 | 0.010 7 |
CMCAN90 | 3 | 1.092 0 | 0.011 0 | 0.084 5 | 0.084 3 | 0.934 8 | 0.190 6 | 0.081 1 | 0.017 4 |
CMCTN7 | 6 | 3.135 9 | 0.906 6 | 0.683 0 | 0.681 1 | 0.334 5 | 1.315 5 | 0.624 1 | 0.497 4 |
CMCTN71 | 11 | 4.089 6 | 0.554 9 | 0.757 6 | 0.755 5 | 0.632 7 | 1.693 3 | 0.728 0 | 0.145 1 |
CMGA104 | 6 | 2.305 6 | 0.071 4 | 0.567 8 | 0.566 3 | 0.936 9 | 1.016 7 | 0.489 8 | 0.016 8 |
CMGAN21 | 12 | 5.358 6 | 0.879 1 | 0.815 6 | 0.813 4 | 0.459 6 | 1.912 2 | 0.790 3 | 0.294 0 |
CMGAN80 | 6 | 2.158 2 | 0.060 4 | 0.538 1 | 0.536 7 | 0.943 7 | 0.878 3 | 0.435 5 | 0.014 9 |
CMMS004 | 12 | 1.648 0 | 0.027 5 | 0.394 3 | 0.393 2 | 0.965 1 | 0.970 1 | 0.380 0 | 0.009 1 |
CMN53_72A | 6 | 1.204 3 | 0.011 0 | 0.170 1 | 0.169 7 | 0.967 6 | 0.407 9 | 0.163 8 | 0.008 4 |
CMTCN30 | 4 | 1.913 3 | 0.038 5 | 0.478 7 | 0.477 3 | 0.959 7 | 0.900 1 | 0.435 3 | 0.010 5 |
CMTCN50 | 8 | 2.561 8 | 0.093 4 | 0.611 3 | 0.609 6 | 0.923 4 | 1.260 9 | 0.556 8 | 0.020 7 |
CMTCN6 | 8 | 5.376 0 | 0.862 6 | 0.816 2 | 0.814 0 | 0.470 1 | 1.763 1 | 0.787 1 | 0.281 8 |
CSCT335 | 6 | 2.501 7 | 0.049 5 | 0.601 9 | 0.600 3 | 0.958 8 | 1.129 2 | 0.535 0 | 0.010 7 |
PM4 | 9 | 4.436 9 | 1.000 0 | 0.776 8 | 0.774 6 | 0.354 5 | 1.614 7 | 0.738 2 | 0.455 2 |
SSR04632 | 5 | 3.501 5 | 0.681 3 | 0.716 4 | 0.714 4 | 0.523 2 | 1.315 3 | 0.660 2 | 0.227 9 |
SSR12083 | 9 | 2.828 6 | 0.022 0 | 0.648 2 | 0.646 5 | 0.983 0 | 1.300 9 | 0.600 4 | 0.004 3 |
合计 Total | 160 | / | / | / | / | / | / | / | / |
平均值 Average | 8.421 1 | 3.077 0 | 0.309 7 | 0.599 1 | 0.597 4 | 0.783 9 | 1.239 9 | 0.555 8 | 0.113 5 |
表3 19对SSR引物的遗传多样性信息
Tab.3 Genetic diversity information of 19 pairs of SSR primers
引物 Primers | 观察等位 基因数 Na | 有效等位 基因数 Ne | 观测杂 合度Ho | 期望杂 合度He | 遗传距 离D | 遗传分化 系数Fst | Shannon's 指数I | 多态性信息 含量PIC | 基因流 Nm |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
C30 | 11 | 3.209 4 | 0.373 6 | 0.690 3 | 0.688 4 | 0.728 6 | 1.460 4 | 0.653 7 | 0.093 1 |
CMAGN33 | 13 | 2.898 2 | 0.142 9 | 0.656 8 | 0.655 0 | 0.890 9 | 1.292 2 | 0.592 1 | 0.030 6 |
CMATN89 | 16 | 6.087 9 | 0.054 9 | 0.838 0 | 0.835 7 | 0.967 1 | 2.061 3 | 0.815 8 | 0.008 5 |
CMBR002 | 9 | 2.155 7 | 0.044 0 | 0.537 6 | 0.536 1 | 0.959 0 | 1.075 2 | 0.493 0 | 0.010 7 |
CMCAN90 | 3 | 1.092 0 | 0.011 0 | 0.084 5 | 0.084 3 | 0.934 8 | 0.190 6 | 0.081 1 | 0.017 4 |
CMCTN7 | 6 | 3.135 9 | 0.906 6 | 0.683 0 | 0.681 1 | 0.334 5 | 1.315 5 | 0.624 1 | 0.497 4 |
CMCTN71 | 11 | 4.089 6 | 0.554 9 | 0.757 6 | 0.755 5 | 0.632 7 | 1.693 3 | 0.728 0 | 0.145 1 |
CMGA104 | 6 | 2.305 6 | 0.071 4 | 0.567 8 | 0.566 3 | 0.936 9 | 1.016 7 | 0.489 8 | 0.016 8 |
CMGAN21 | 12 | 5.358 6 | 0.879 1 | 0.815 6 | 0.813 4 | 0.459 6 | 1.912 2 | 0.790 3 | 0.294 0 |
CMGAN80 | 6 | 2.158 2 | 0.060 4 | 0.538 1 | 0.536 7 | 0.943 7 | 0.878 3 | 0.435 5 | 0.014 9 |
CMMS004 | 12 | 1.648 0 | 0.027 5 | 0.394 3 | 0.393 2 | 0.965 1 | 0.970 1 | 0.380 0 | 0.009 1 |
CMN53_72A | 6 | 1.204 3 | 0.011 0 | 0.170 1 | 0.169 7 | 0.967 6 | 0.407 9 | 0.163 8 | 0.008 4 |
CMTCN30 | 4 | 1.913 3 | 0.038 5 | 0.478 7 | 0.477 3 | 0.959 7 | 0.900 1 | 0.435 3 | 0.010 5 |
CMTCN50 | 8 | 2.561 8 | 0.093 4 | 0.611 3 | 0.609 6 | 0.923 4 | 1.260 9 | 0.556 8 | 0.020 7 |
CMTCN6 | 8 | 5.376 0 | 0.862 6 | 0.816 2 | 0.814 0 | 0.470 1 | 1.763 1 | 0.787 1 | 0.281 8 |
CSCT335 | 6 | 2.501 7 | 0.049 5 | 0.601 9 | 0.600 3 | 0.958 8 | 1.129 2 | 0.535 0 | 0.010 7 |
PM4 | 9 | 4.436 9 | 1.000 0 | 0.776 8 | 0.774 6 | 0.354 5 | 1.614 7 | 0.738 2 | 0.455 2 |
SSR04632 | 5 | 3.501 5 | 0.681 3 | 0.716 4 | 0.714 4 | 0.523 2 | 1.315 3 | 0.660 2 | 0.227 9 |
SSR12083 | 9 | 2.828 6 | 0.022 0 | 0.648 2 | 0.646 5 | 0.983 0 | 1.300 9 | 0.600 4 | 0.004 3 |
合计 Total | 160 | / | / | / | / | / | / | / | / |
平均值 Average | 8.421 1 | 3.077 0 | 0.309 7 | 0.599 1 | 0.597 4 | 0.783 9 | 1.239 9 | 0.555 8 | 0.113 5 |
[1] | 王建玉, 邓志斌, 张爱萍, 等. 甜瓜种质资源遗传多样性的SSR分析[J]. 中国蔬菜, 2013, 1(18): 42-47. |
WANG Jianyu, DENG Zhibin, ZHANG Aiping, et al. Analysis of melon germplasms genetic diversity by SSR markers[J]. China Vegetables, 2013, 1(18): 42-47. | |
[2] | Saha K, Choudhary H, Munshi A D, et al. Genetic characterization and population structure analysis among different horticultural groups of muskmelon (Cucumis melo L.) using microsatellite markers[J]. Plant Genetic Resources: Characterization and Utilization, 2022, 20(2): 116-123. |
[3] | Liu S, Gao P, Zhu Q L, et al. Resequencing of 297 melon accessions reveals the genomic history of improvement and loci related to fruit traits in melon[J]. Plant Biotechnology Journal, 2020, 18(12): 2545-2558. |
[4] | 崔浩楠. 甜瓜白粉病抗性基因Cmpmr 2F的精细定位及候选基因分析[D]. 哈尔滨: 东北农业大学, 2021. |
CUI Haonan. Fine mapping and candidate gene analysis of powdery mildew resistance gene Cmpmr 2F in melon[D]. Haerbin:Northeast Agricultural University, 2021. | |
[5] | 张凯歌, 胡倩梅, 靳志恒, 等. 219份甜瓜种质资源的遗传多样性分析[J]. 河南农业大学学报, 2020, 54 (2): 216-230. |
ZHANG Kaige, HU Qianmei, JIN Zhiheng, et al. Genetic diversity analysis of 219 melon germplasms[J]. Journal of Henan Agricultural University, 2020, 54(2): 216-230. | |
[6] | 徐小军, 刘海英, 梁长志, 等. 不同类型甜瓜种质SSR遗传多样性及耐冷性评价[J]. 植物遗传资源学报, 2020, 21(3): 568-578. |
XU Xiaojun, LU Haiying, LIANG Changzhi, et al. Genetic diversity analysis of melon germplasms using SSR markers and tests for chilling tolerance[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2020, 21(3): 568-578. | |
[7] | 卿东山, 江鸿, 张露瑶, 等. 甜瓜种质资源形态学性状遗传多样性分析[J]. 中国蔬菜, 2023,(4): 39-49. |
QING Dongshan, JIANG Hong, ZHANG Luyao, et al. Analysis of genetic diversity of melon(Cucumis melo L.) germplasm resources based on mor phological characters[J]. China Vegetables, 2023,(4): 39-49. | |
[8] | 王志强, 杜慧莹, 李程, 等. 甜瓜亲本资源果实性状的遗传多样性分析[J]. 内蒙古农业大学学报(自然科学版), 2022, 43(6): 7-13. |
WANG Zhiqiang, DU Huiying, LI Cheng, et al. Genetic diversity analysis of fruit characters of melon parents[J]. Journal of Inner Mongolia Agricultural University(Natural Science Edition), 2022, 43(6): 7-13. | |
[9] | 王吉明, 尚建立, 李娜, 等. 引进国外的野生甜瓜种质资源果实形态多样性分析[J]. 果树学报, 2017, 34(3): 295-302. |
WANG Jiming, SHANG Jianli, LI Na, et al. Genetic diversity analysis in imported wild melon (Cucumis melo L.) germplasm resources based on morphological characters[J]. Journal of Fruit Science, 2017, 34(3): 295-302. | |
[10] |
胡建斌, 马双武, 简在海, 等. 中国甜瓜种质资源形态性状遗传多样性分析[J]. 植物遗传资源学报, 2013, 14(4): 612-619.
DOI |
HU Jianbin, MA Shuangwu, JIAN Zaihai, et al. Analysis of genetic diversity of Chinese melon(Cucumis melo L.) germplasm resources based on morphological characters[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2013, 14(4): 612-619. | |
[11] | 张永兵, 伊鸿平, 马新力, 等. 新疆甜瓜地方品种资源核心种质构建[J]. 植物遗传资源学报, 2013, 14(1): 52-57. |
ZHANG Yongbing, YI Hongping, MA Xinli, et al. Construction of core collection of melon landraces in Xinjiang[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2013, 14(1): 52-57. | |
[12] | 郭丽霞, 李寐华, 王豪杰, 等. 塔吉克斯坦甜瓜地方品种资源表型遗传多样性[J]. 新疆农业科学, 2015, 52 (5): 837-842. |
GUO Lixia, LI Meihua, WANG Haojie, et al. Genetic diversity of melon landraces (Cucumis melo L.) in Tajikistan based on phenotypic characters[J]. Xinjiang Agricultural Science, 2015, 52(5): 837-842. | |
[13] | 张永兵, 李寐华, 吴海波, 等. 新疆甜瓜地方品种资源的表型遗传多样性[J]. 园艺学报, 2012, 39(2): 305-314. |
ZHANG Yongbing, LI Meihua, WU Haibo, et al. Genetic diversity of melon landraces(Cucumis melo L.) in Xinjiang based on phenotypic characters[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2012, 39(2): 305-314. | |
[14] | 杨永, 王豪杰, 张学军, 等. 新疆甜瓜地方种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 植物遗传资源学报, 2017, 18(3): 436-448. |
YANG Yong, WANG Haojie, ZHANG Xuejun, et al. Genetic diversity analysis of melon landraces (Cucumis melo) in Xinjiang based on SRAP markers[J]. Journal of Plant Genetic Resources, 2017, 18(3): 436-448. | |
[15] | Zhu H Y, Guo L Q, Song P Y, et al. Development of genome-wide SSR markers in melon with their cross-species transferability analysis and utilization in genetic diversity study[J]. Molecular Breeding 2016, 36(11): 153-167. |
[16] | 张金鹏. 遗传作图群体中SSR基因型分型软件开发及杨树SSR遗传图谱构建[D]. 南京: 南京林业大学, 2022. |
ZHANG Jinpeng. Software development of SSR genotyping across a genetic mapping population and construction of SSR genetic maps in Populus[D]. Nanjing: Nanjing Forestry University, 2022. | |
[17] | Wang X L, Yang X Q, Yao J T, et al. Genetic linkage map construction and QTL mapping of blade length and width in Saccharina japonica using SSR and SNP markers[J]. Frontiers in Marine Science, 2023, 10: 1116412. |
[18] | 冉昆, 隋静, 王宏伟, 等. 利用SSR荧光标记构建山东地方梨种质资源分子身份证.果树学报[J], 2018, 35(增刊): 71-78. |
RAN Kun, SUI Jing, WANG Hongwei, et al. Using the fluorescent labeled SSR markers to establish the molecular ID of pear germplasm resources in Shandong [JJournal of Fruit Science. 2018, 35(S): 71-78. | |
[19] | Alhariri A, Behera T K, Jat G S, et al. Analysis of ge- netic diversity and population structure in bitter gourd (Momordica charantia L.) using morphological and SSR markers[J]. Plants, 2021(9): 1860. |
[20] | Zhang Q H, Zang X X, Yang Y C, et al. Genetic diversity of Juglans mandshurica populations in northeast china based on SSR markers[J]. Frontiers in Plant Science, 2022, 13: 931578. |
[21] |
李超, 杨英, 陈伟, 等. 西州密系列甜瓜 SSR 指纹图谱构建及聚类分析[J]. 园艺学报, 2022, 49(3): 622-632.
DOI |
LI Chao, YANG Ying, CHEN Wei, et al. Construction of DNA fingerprinting and clustering analysis with SSR markers for the muskmelon of Xizhoumi Series[J]. Acta Horticulturae Sinica, 2022, 49(3): 622-632.
DOI |
|
[22] | 翟文强, 王豪杰, 李俊华, 等. 喀什地区厚皮甜瓜品种资源遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2011, 48(1): 64-69. |
ZHAI Weiqiang, WANG Haojie, LI Junhua, et al. Analysis of genetic diversity in melon variety resources in Kashgar region[J]. Xinjiang Agricultural Sciences, 2011, 48(1): 64-69. | |
[23] | Zhang Y B, Fan X B, Aierken Y, et al. Genetic diversity of melon landraces (Cucumis melo L.) in the Xinjiang Autonomous Region on the basis of simple sequence repeat markers[J]. Genetic Resources and CropEvolution, 2017, 64: 1023-1035. |
[24] |
王璐伟, 沈志军, 李贺欢, 等. 基于SSR 荧光标记的79份桃种质遗传多样性分析[J]. 中国农业科学, 2022, 55(15): 3002-3017.
DOI |
Wang Luwei, SHEN Zhijun, LI Hehuan, et al. Analysis of genetic diversity of 79 cultivars based on SSR fluorescence markers for peach[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2022, 55(15): 3002-3017.
DOI |
|
[25] | 刘松, 聂兴华, 李伊然, 等. 基于SSR荧光标记构建板栗品种(系)核心种质群[J]. 果树学报, 2023, 40(2): 230-241. |
LIU Song, NIE Xinghua, LI Yiran, et al. Construction of core germplasm collection of Chinese chestnut cultivars (lines) based on SSR fluorescence markrs[J]. Journal of Fruit Science, 2023, 40(2): 230-241. | |
[26] | 侯丽媛, 董艳辉, 聂园军, 等. 苹果属种质 TP-M13-SSR 亲缘关系及遗传多样性分析[J]. 山西农业科学, 2020, 48(9): 1371- 1378, 1522. |
HOU Liyuan, DONG Yanhui, NIE Yuanjun, et al. Analysis of phylogenetic relationship and genetic diversity of TP-M13-SSR technique for some malus germplasm[J]. Journal of Shanxi Agricultural Sciences, 2020, 48(9): 1371-1378, 1522. | |
[27] | 解华云, 高崇敏, 叶云峰, 等. 基于TP-M13-SSR分子标记技术的133份薄皮甜瓜种质资源遗传多样性分析[J]. 南方农业学报. 2022, 53(9): 2547-2556. |
XIE Huayun, GAO Chongmin, YE Yunfeng, et al. Genetic diversity analysis of 133 pellicle melon germplasm resources based on TP-M13-SSR molecular marker technology[J]. Journal of Southern Agriculture, 2022, 53(9): 2547-2556. | |
[28] | 吴仕蔓, 娄兵海, 陈传武, 等. 应用SSR荧光标记法构建22个柚类品种的分子身份证[J]. 果树学报, 2023, 40(4): 605-614. |
WU Shiman, LOU Binghai, CHEN Chuanwu, et al. Establishment of molecular identity of 22 pomelo varieties using fluorescent labeled SSR markers[J]. Journal of Fruit Science, 2023, 40(4): 605-614. | |
[29] |
位明明, 黄肖, 李维国, 等. 利用 SSR 荧光标记构建 37 个中国橡胶树栽培品种指纹图谱[J]. 热带作物学报, 2022, 43(8): 1565-1576.
DOI |
WEI Mingming, HUANG Xiao, LI Weiguo, et al. Using the SSR fluorescent labeling to establish SSR fingerprints for 37 cultivars in rubber tree (Hevea brasiliensis)[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2022, 43(8): 1565-1576.
DOI |
|
[30] |
张志军, 黄克兴, 岳杰, 等. TP-M13-SSR技术在麦芽品种鉴定中的应用[J]. 食品科学. 2018, 39(24): 183-188.
DOI |
ZHANG Zhijun, HUANG Kexing, YUE Jie, et al. DNA fingerprinting of malt varieties using tailed primer M13 mi crosatellite (TP-M13-SSR) markers[J]. Food Science, 2018, 39(24): 183-188.
DOI |
|
[31] | 李超, 孙玉萍, 杨英, 等. 应用 SSR 标记鉴定甜瓜新品种纯度与真实性研究[J]. 分子植物育种, 2017, 15(8): 3088- 3096. |
LI Chao, SUN Yuping, YANG Ying, et al. Application of SSR markers in purity and authenticity identification for melon new hybrid[J]. Molecular Plant Breeding, 2017, 15(8): 3088-3096. | |
[32] | 穆小婷, 廖侦成, 凌彩金, 等. 基于SSR标记的55份清远野生茶树种质资源遗传多样性和亲缘关系分析[J]. 中国茶叶, 2023, 45(2): 36-43. |
MU Xiaoting, LIAO Zhicheng, LING Caijin, et al. Genetic Diversity and Relationship Analysis of 55 Wild Tea Germplasm from Qingyuan based on SSR Markers[J]. China Tea, 2023, 45(2): 36-43. | |
[33] | Ansari W A, Atri N, Yang L, et al. Genetic diversity in muskmelon based on SSR markers and morphological traits under well-watered and water-deficit[J]. Biocatalysis and Agricultural Biotechnology, 2020, 26(4): 101630. |
[34] | Carvalho N, Canela F M, Leite P H S, et al. Research Article Analysis of genetic variability of commercial melon cultivars using SSR molecular markers[J]. Genetics and Molecular Research, 2017. 16(3): 16039739. |
[35] | Chikh-rouhou H, Mezghani N, Mnasri S, et al. Assessing the Genetic Diversity and Population Structure of a Tunisian Melon (Cucumis melo L.) Collection Using Phenotypic Traits and SSR Molecular Markers[J]. Agronomy, 2021, 11(6): 11061121. |
[36] | Kacar Y A, Simsek O, Solmaz I, et al. Genetic diversity among melon accessions (Cucumis melo) from Turkey based on SSR markers[J]. Genetics and Molecular Research. 2012, 11(4): 4622. |
[37] | Luan F S, Delannay I, Staub J E. Chinese melon(Cucumis melo L.) diversity analyses provide strategies for germplasm curation, genetic improvement, and evidentiary support of domestication patterns[J]. Euphytica 2008, 164(2): 445-461. |
[38] | 吴娴, 徐海峰, 张志斌, 等. 基于KASP标记的贵州禾群体遗传多样性与结构分析[J]. 分子植物育种, 2021, 19(4): 1345-1353. |
WU Xian, XU Haifeng, ZHANG Zhibin, et al. Genetic Diversity and Population Structure Study of Guizhou He Based on KASP Marker[J]. Molecular Plant Breeding, 2021, 19(4): 1345-1353. | |
[39] | 王美荣, 许勇, 詹永乐, 等. 甜瓜育种亲本材料遗传多样性及群体结构的SSR标记分析[J], 华北农学报, 2010, 25(增刊): 41-46. |
WANG Meirong, XU Yong, ZHAN Yongle, et al. Analysis of Genentic Diversity and Population Structure in Melon (Cucumis melo L.) Breeding Materials by SSR Markers[J], Acta Agriculture Boreali-Sinica, 2010, 25(S): 41-46. | |
[40] |
Evanno G, Regnaut S, Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software structure: a simulation study[J]. Molecular Ecology, 2005, 14(8): 2611-2620.
DOI PMID |
[41] | Andrade I S, de Melo C A F, de Sousa Nunes G H, et al. Phenotypic variability, diversity and genet ic population structure in melon (Cucumis melo L.) Associated with total soluble solids[J]. Scientia Horticulturae, 2021, 278 (1): 109844. |
[42] | 陈芸, 李冠, 王贤磊. 甜瓜种质资源遗传多样性的SRAP分析[J]. 遗传, 2010, 32(7): 744-751. |
CHEN Yun,LI Guan, WANG Xianlei. Genetic diversity of a germplasm collection of Cucumis melo L.using SRAP markers[J]. Hereditas (Beijing), 2010, 32(7): 744-751. |
[1] | 曾婉盈, 耿洪伟, 程宇坤, 李思忠, 钱松廷, 高卫时, 张立明. 甜菜品系叶丛快速生长期抗旱性综合评价[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(9): 2140-2151. |
[2] | 徐毛毛, 高杰, 李君明, 李鑫, 刘磊, 潘峰. 20个番茄商业品种群体的多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(9): 2191-2196. |
[3] | 苗雨, 陈翠霞, 马艳明, 邢国芳, 董裕生, 陈智军, 王仙, 向莉. 276份中亚大麦种质资源表型性状的遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(8): 1888-1895. |
[4] | 杨梅, 赵红梅, 迪丽热巴·夏米西丁, 杨卫君, 张金汕, 惠超. 氮肥减量配施生物质炭对春小麦群体结构、光合特性及产量的影响[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(7): 1582-1589. |
[5] | 杨璐, 王娜, 范少丽, 程平, 李宏, 汪阳东. 黑桑种质资源表型性状变异特征分析[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(5): 1172-1181. |
[6] | 王帆, 李玉姗, 王威, 邓超宏, 赵连佳, 马越, 肖菁, 庄红梅, 许红军. 基于表型性状鉴定及SSR分子标记分析芜菁种质资源遗传多样性[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(11): 2601-2613. |
[7] | 汪天玲, 侯献飞, 施俊杰, 孙全喜, 贾东海, 顾元国, 单世华, 苗昊翠, 李强. 67份匍匐型花生种质资源遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2024, 61(1): 42-54. |
[8] | 张雁飞, 苏比娜·肖克来提, 杨磊, 郝庆, 靳娟, 樊丁宇. 26个鲜食枣品种SSR指纹图谱构建与遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(7): 1671-1678. |
[9] | 逯涛, 曾庆涛, 张文, 王文博, 王政洋, 杨芮, 孙玉岩. 主成分分析及灰色关联度分析综合评价棉花产量与品质[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(5): 1099-1109. |
[10] | 陈开旭, 郭翠洁, 杨帆, 任斐儿, 李晓斌, 刘武军. 基于全基因组重测序分析新疆细毛羊遗传多样性[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(5): 1292-1300. |
[11] | 杨建超, 徐诚, 杨平, 杨鸿基, 张凯浩, 马新超, 高亚宁, 陈有福, 付湘, 轩正英. 氮素指数施肥对设施薄皮甜瓜养分承载及氮吸收利用的影响[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(3): 590-600. |
[12] | 文佳, 黄陈珏, 嵇子涵, 李黎贝, 冯震, 喻树迅. 陆地棉动态株高与SSR标记的关联分析[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(12): 2892-2901. |
[13] | 罗影, 努尔孜亚·亚力买买提, 贾文捷, 刘洁莹, 贾培松. 新疆野生大环柄菇的分子鉴定与遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(10): 2501-2508. |
[14] | 姚莹莹, 李家辉, 李海英, 吴盈萍, 赵晓钰, 周军, 赵全庄, 李宗福. 也迷里鸡微卫星遗传多样性分析[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(10): 2574-2582. |
[15] | 马君, 杨延龙, 师维军, 汪鹏龙, 郑巨云, 郭仁松, 胡文冉, 杨洋. 棉花陆海渐渗杂交群体纤维品质性状的QTL定位[J]. 新疆农业科学, 2023, 60(1): 11-16. |
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