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沙棘耐盐基因HrNHX1的克隆及3'UTR序列分析

郭长奎;罗淑萍;沙依拉;于静   

  1. 新疆农业大学,乌鲁木齐,830052
  • 收稿日期:2009-05-25 修回日期:2009-05-25 出版日期:2009-05-25 发布日期:2009-05-25

Cloning of Buckthorn Salt-tolerance HrNHX1 Gene and Sequence Analysis of 3'UTR

GHO Chang-kui;LUO Shu-ping;Shayila;YU Jing   

  • Received:2009-05-25 Revised:2009-05-25 Published:2009-05-25 Online:2009-05-25

摘要: 以沙棘(Hippophae rhamnoides L.)叶片为材料,用改良SDS法提取总RNA,反转录合成第一链cDNA作为模板,根据已公布NHX1家族同源序列保守区设计简并引物,扩增出沙棘中HrNHX1基因的中间序列,然后用快速扩增cDNA末端(rapid amplification on of cDNA end,RACE)方法,从沙棘中克隆到HrNHX13'cDNA序列.该序列(GenBank登录号:EU718492)长度为1 373 bp,与已知NHXI序列同源性最大为80;,其编码区1 094 bp,编码364个氨基酸,3'非翻译区(3'-untranslated resion,3'trm)长度为239 bp.3'UTR序列分析显示沙棘的3'UTR与陆地棉、葡萄柚和小盐芥的同源性分别为43.97;、45.63;和40.64;,明显低于编码区的同源性.结果表明,NHX1基因编码区具有较高的保守性,3'UTR序列的同源性较低,显示了非编码区在环境适应中的重要性,并为进一步研究沙棘对生境的适应分子机制奠定了基础.


ISSN 1001-4330 CN 65-1097/S
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