中国美利奴(新疆型)羊毛弯曲频率性状的全基因组关联分析

中国美利奴(新疆型)羊毛弯曲频率性状的全基因组关联分析

狄江;刘剑锋;徐新明;拉扎特·艾尼瓦尔;于丽娟

新疆畜牧科学院,乌鲁木齐,830000;中国农业大学动物科技学院,北京,100193

收稿日期:2015-11-25 修回日期:2015-11-25 出版日期:2015-11-25 发布日期:2015-11-25

Genome-wide Association Studies on the Wool Staple Crimp Frequency in Chinese Merino Sheep (Xinjiang Type)

DI Jiang;LIU Jian-feng;XU Xin-ming;Lazate Ainiwaer;YU Li-juan

Received:2015-11-25 Revised:2015-11-25 Online:2015-11-25 Published:2015-11-25

摘要/Abstract

摘要： [目的]鉴别影响细羊毛弯曲频率性状的基因组区域.[方法]利用OvineSNP50 BeadChip芯片对235只中国美利奴(新疆型)个体基因分型,基于Case/Control设计对弯曲频率性状进行全基因组关联分析.[结果]通过基因组水平的Permutations校正,检测到18个与细羊毛弯曲频率性状显著关联的SNPs.5个SNPs定位于已知基因内(内含子),13个SNPs分别邻近已知基因(距离1.8 kb～841.39 kb).多数候选基因/SNP均为首次检测到与羊毛性状相关,其中基因PML、LAMC2、PDGF、CDC42SE2及DiRas3参与了人、小鼠毛发生长、发育相关的生物学过程.[结论]鉴别出了与羊毛弯曲频率性状关联的新的候选基因/SNP,对这些目标区域的进一步研究有助于揭示细毛羊羊毛弯曲性状的遗传机理.

狄江;刘剑锋;徐新明;拉扎特·艾尼瓦尔;于丽娟. 中国美利奴(新疆型)羊毛弯曲频率性状的全基因组关联分析[J]. .

DI Jiang;LIU Jian-feng;XU Xin-ming;Lazate Ainiwaer;YU Li-juan. Genome-wide Association Studies on the Wool Staple Crimp Frequency in Chinese Merino Sheep (Xinjiang Type)[J]. .