抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)淀粉分支酶SBE Ⅱa和SBE Ⅱb基因多态性分析

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抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)淀粉分支酶SBE Ⅱa和SBE Ⅱb基因多态性分析

王昊龙;韩俊杰;李卫华;刘伟

石河子大学农学院/新疆兵团绿洲生态农业重点实验室,新疆石河子,832003;石河子大学医学院/新疆地方病与民族高发病教育部重点实验室,新疆石河子,832003

收稿日期:2015-06-25 修回日期:2015-06-25 出版日期:2015-06-25 发布日期:2015-06-25

Polymorphism Analysis of SBE Ⅱ a and SBE Ⅱ b Originated from Different Spring Wheat Cultivars with Starch Resistant Contents

WANG Hao-long;HAN Jun-jie;LI Wei-hua;LIU Wei

Received:2015-06-25 Revised:2015-06-25 Online:2015-06-25 Published:2015-06-25

摘要/Abstract

摘要： [目的]克隆抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)中淀粉合成酶关键基因SBEⅡa和SBEⅡb进行多态性分析,从分子水平阐述不同小麦品种(系)间抗性淀粉含量差异的原因.[方法]根据GeneBank中公布的小麦SBEⅡa(AF286319.1)和SBEⅡb(AY740401.1)基因序列设计特异性引物,利用RT-PCR技术克隆SBEⅡa和SBEⅡb基因序列,利用Clustal.W进行测序结果的比对分析,NCBI Conserved domain和intePro在线网站对SBEⅡa和SBEⅡb氨基酸序列进行结构域预测,寻找影响抗性淀粉含量的主效基因位点.[结果]克隆了SBEⅡa(2 471 bp)、SBEⅡb(2 510 bp)基因ORF(open reading frame,ORF)全长.序列分析表明:SBEⅡa、SBEⅡb基因与公布的序列同源性分别为98.64;和99.07;.[结论]SBEⅡa基因ORF的三个结构域中未发现影响籽粒抗性淀粉含量的候选差异位点.在SBEⅡb基因编码区羧基C-末端的3个候选差异位点和α-淀粉催化酶结构域的1个候选差异位点可能是造成小麦品种(系)间抗性淀粉含量差异的原因.SBEⅡa、SBEⅡb氨基N-末端前面序列中共计10个单碱基变异作为潜在差异位点,也可能参与SBE基因的表达.

王昊龙;韩俊杰;李卫华;刘伟. 抗性淀粉含量不同的小麦品种(系)淀粉分支酶SBE Ⅱa和SBE Ⅱb基因多态性分析[J]. .

WANG Hao-long;HAN Jun-jie;LI Wei-hua;LIU Wei. Polymorphism Analysis of SBE Ⅱ a and SBE Ⅱ b Originated from Different Spring Wheat Cultivars with Starch Resistant Contents[J]. .