西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析

西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析

何丹;海利力·库尔班;玉山江·麦麦提;李继阳;杨渡;韩盛

新疆农业大学林学与园艺学院,乌鲁木齐,830091;新疆农业科学院植物保护研究所,乌鲁木齐,830091

收稿日期:2015-06-25 修回日期:2015-06-25 出版日期:2015-06-25 发布日期:2015-06-25

Coat Protein Gene Cloning and Sequence Analysis of Watermelon Mosaic Virus (WMV) in Xinjiang Main Planting Areas

HE Dan;Halili Kuerban;Yushanjiang Meimeiti;LI Ji-yang;YANG Du;HAN Sheng

Received:2015-06-25 Revised:2015-06-25 Online:2015-06-25 Published:2015-06-25

摘要/Abstract

摘要： [目的]研究新疆甜瓜主栽区西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白的分类地位,以及与国内外分离株亲缘关系.[方法]田间采集具有西瓜花叶病毒症状的幼嫩叶片,利用改良的TRIZOL总RNA提取法获取RNA,进一步分离纯化、克隆及测序,将测序结果利用BLAST、DNAMAN 5.0、CLUSTAL X、MEGA 5.0 EXPASY、TM-HMM等软件进行碱基和氨基酸序列比对,以及疏水性平均值、脂肪系数、亲缘关系等分析.[结果]序列比对发现8个地区WMV病毒外壳蛋白核酸序列的5'端保守性较高,碱基和氨基酸序列相似性分别达到86.25;和93.01;,存在部分碱基和氨基酸突变,相似性较高.[结论]通过分子进化树可得出新疆8个分离物之间亲缘性关系较近,同源性较高,与国内外其它地区的亲缘性关系较远、同源性较低.

何丹;海利力·库尔班;玉山江·麦麦提;李继阳;杨渡;韩盛. 西瓜花叶病毒(WMV)外壳蛋白基因克隆及序列分析[J]. .

HE Dan;Halili Kuerban;Yushanjiang Meimeiti;LI Ji-yang;YANG Du;HAN Sheng. Coat Protein Gene Cloning and Sequence Analysis of Watermelon Mosaic Virus (WMV) in Xinjiang Main Planting Areas[J]. .