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ARMS-PCR对棉花SNP分型的研究

郑炜佳;曲延英;谢元元;陈全家;冯文林;马顺尧;柴颜军;梁维维   

  1. 新疆农业大学农学院,乌鲁木齐,830052
  • 收稿日期:2013-12-25 修回日期:2013-12-25 出版日期:2013-12-25 发布日期:2013-12-25

Study on SNP Genetic Typing of Sea-island Cotton Genome Group

  • Received:2013-12-25 Revised:2013-12-25 Online:2013-12-25 Published:2013-12-25

摘要: [目的]在已知SNP的情况下,找到适合棉花SNP的简便验证方法.[方法]利用四引物扩增突变体系(tetra-primer amplification refractory mutationsystem PCR,Tetra-primer ARMS-PCR)对槔花SNP分型进行验证.[结果]根据深圳华大基因已组装的棉花转录本做为参考,分别将新海21号和新陆中36号的转录组测序样品比对到参考基因,通过SOAPsnp技术检测样品的单核苷酸多态性.棉花海陆杂交亲本的38个单核苷酸多态性位点设计出的66组SNP引物进行验证.通过优化PCR反应体系,反应条件,调整内外引物浓度和PCR体系的优化,从66组引物中扩增出11组引物,得到了良好的分型效果.[结论]四引物扩增受阻突变体系聚合酶链式反应是一种简单快捷而有效的SNP基因分形方法.


ISSN 1001-4330 CN 65-1097/S
邮发代号:58-18
国外代号:BM3342
主管:新疆农业科学院
主办:新疆农业科学院 新疆农业大学 新疆农学会

出版单位:《新疆农业科学》编辑部
地址:乌鲁木齐市南昌路403号新疆农业科学院
邮编:830091
电话:0991-4502046
E-mail:xjnykx-h@xaas.ac.cn


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